علی مطهری رویکرد آمرانه آمریکا در مسائل بین‌المللی را نقد کرد و گفت ترامپ خود را پادشاه جهان می‌داند. او تأکید کرد تا آمریکا قدرت ایران را درک نکند، مذاکره عادلانه‌ای نخواهد بود. مطهری راهکار را ایستادگی، انسجام ملی و تقویت اقتصاد و نیروی نظامی دانست.
علی مطهری برای سفر رئیس‌جمهور به نیویورک سه پیشنهاد ارائه کرد: مذاکره با سه کشور اروپایی، تشریح واقعیت حملات اسرائیل و آمریکا، و پذیرش دیدار احتمالی با ترامپ در صورت درخواست، با تأکید بر منافع ملی و بهره‌گیری از کیش شخصیت ترامپ به سود ایران.
علی مطهری گفت اصل کنسرت مشکل شرعی ندارد اما محتوا مهم است. در شرایط فعلی موسیقی باید حماسی باشد نه عاشقانه. مخالفان نظام انگیزه سیاسی دارند و می‌خواهند شجریان علیه نظام کنسرت برگزار کند. تصمیم شجریان برای تقویت همبستگی است.
علی مطهری در یادداشتی به کشتار علویان سوریه توسط تکفیری‌ها واکنش نشان داده و سکوت جهان اسلام را در مقابل این جنایت، به جز اعتراضات مردم ترکیه و رهبر انصارالله یمن، مورد انتقاد قرار داده است. او خواستار انجام مطالعات روانشناختی و جامعه‌شناختی درباره ریشه‌های این خشونت و نقش احتمالی اسرائیل و آمریکا شده است.
علی مطهری معتقد است با شرایطی که ترامپ ایجاد کرده و همراه با تهدید نظامی، مذاکره فایده‌ای ندارد. او تأکید می‌کند رهبری نیز بر این باور است که با طرفی که با تهدید پیش می‌آید، نمی‌توان مذاکره کرد. مطهری همچنین از موضع اروپا انتقاد کرده و آن‌ها را به بی‌تعهدی در برجام متهم می‌کند.
علی مطهری در واکنش به تجمع علیه ظریف، بر حق آزادی بیان تأکید کرد. وی این تجمعات را قانونی دانست و گفت مخالفان نیز حق پاسخگویی دارند. مطهری تصریح کرد قضاوت درباره محتوای شعارها با مردم است.